淋病的病原体是淋病双球菌，属奈瑟菌属。1879年，Neisser首次分别出淋病双球菌，所以淋病双球菌又称为奈瑟双球菌（NeisseriaGonrhoeae）。1885年Bamm在凝结血清培养基上培养淋球菌得克制利。
淋球菌的局面与脑膜炎双球菌雷同，呈园形，卵园形或肾形，常成对指挥，附近面扁平或略低陷，大小为0.6μm×0.8μm，革兰氏染色阴性，呈粉红色。美蓝染色呈蓝色。急性期病号淋球菌习见于分泌物白细胞的细胞内，而慢性期多在白细胞外。淋球菌的违抗力较弱，怕大旱，钟爱在潮湿、温度为35~36℃、含2.5%-5%二氧化碳田地中增长。在完全干燥的环境中只能生息1~2小时,在微湿的衣裤、毛巾、被褥中能生息18-24小时，而在50℃时仅生息5分钟。淋球菌对常用的杀菌剂顽抗力很弱，1：4000硝酸银7分钟可将其杀死，在1%的石碳酸内3分钟凋落。
淋球菌的外膜由脂多糖、外膜蛋白及菌毛组成，且有寄生和致病作用。
菌毛（Pili）由多肽组成，有抗原性，其止境的氨基酸安顿较恒定，而中段及羧基端的氨基酸安排顺序常涌现改变而决计两样菌株的菌毛的抗原多样性。菌毛与淋球菌的附着性有关，同时也有阻止白细胞吞噬的作用。培养20小时的菌落，其细胞外形具有菌毛，具有传染性。菌落衰老时菌毛亦消逝，接种尿道不引发尿道炎。
淋球菌的外膜蛋白最低有三种，其中蛋白I为主蛋白，占外膜蛋白的60%，两种淋球菌的蛋白I的抗原性两样。该抗原性质安定，故可以以此制成单克隆抗体对淋球菌执行血清学分型。它以差异形态呈现即PIA和PIB。它可在细胞膜上造成孔道。使水溶性物质、另外对细菌代谢有首要作用的物质及某些抗生素可路过细胞膜进来细胞内。蛋白Ⅱ与淋球菌同人类上皮细胞、白细胞的粘合及细胞间的粘合有关，具备热妆饰性。蛋白Ⅲ具有返本还原润饰性，又称Rmp，有强免疫原性，与同种除外奈瑟氏菌有交叉反应，能中断除外抗体的杀菌作用。近年还感觉有铁调节性蛋白称Frp，在缺铁时表露铁的受体。
脂多糖为淋球菌关键的外形制作之一，为淋菌的内毒素，与粘膜下和体内补体协同产生炎症反响、与淋球菌的毒力、致病性和免疫性有关。现已讯断6种抗原性两样的淋球菌脂多糖。